Il viaggio del nuovo coronavirus dagli animali all'uomo. Le nuove ipotesi

SARS-CoV-2 potrebbe essere passato in più occasioni e da più animali alle persone, secondo un'analisi preliminare pubblicata sul forum di discussione Virological.org. I dati che supporterebbero questa ipotesi, tuttavia, devono essere verificati, e l'analisi non è stata ancora sottoposta a peer-review. Le prime sequenze virali, prelevate da persone infette alla fine del 2019 e all'inizio del 2020, sono divise in due linee (lineage), note come A e B, che presentano differenze genetiche chiave. Il lineage B è diventato dominante a livello globale e include campioni prelevati da persone che hanno visitato il mercato del pesce a Wuhan, che vendeva anche animali selvatici. Il lineage A si è diffuso in Cina e include campioni di persone collegate ad altri mercati a Wuhan.

Gli esperti si sono chiesti come fossero correlate le due linee virali. Infatti, se i virus del lineage A si fossero evoluti da quelli del B, o viceversa, ciò suggerirebbe che il progenitore del virus è passato solo una volta dagli animali alle persone. Ma se le due linee avessero origini separate, allora potrebbero esserci stati più eventi di spillover, e questo studio supporta proprio tale ipotesi. Le linee A e B sono definite da due differenze chiave dei nucleotidi, ma alcuni dei primi genomi hanno una combinazione di queste differenze. I ricercatori in precedenza pensavano che questi genomi potessero essere quelli dei virus nelle fasi intermedie dell'evoluzione e che quindi collegassero le due linee, ma gli esperti che hanno seguito l'ultima analisi li hanno esaminati in dettaglio e hanno notato alcuni problemi. Hanno infatti scoperto che molte di queste sequenze contenevano anche mutazioni in altre regioni del genoma, proprie della linea A o B. Gli autori suggeriscono che probabilmente si sia verificato un errore di laboratorio o del computer durante il sequenziamento di una delle due mutazioni in questi genomi intermedi. «È molto improbabile che uno qualsiasi dei genomi intermedi sia in realtà un genoma di transizione. Se il virus è passato tra animali e persone in diverse occasioni, il fatto che le linee A e B siano collegate a individui che hanno visitato diversi mercati a Wuhan suggerisce che più animali, di una o più specie, abbiano infettato persone in almeno due luoghi» conclude Joel Wertheim, della University of California di San Diego, autore senior dello studio.

Virological.org 2021
https://virological.org/t/evidence-against-the-veracity-of-sars-cov-2-genomes-intermediatebetween-lineages-a-and-b/754